المركز الطبي بجامعة حفر الباطن هو أحد الركائز الأساسية بالجامعة حيث تم إنشاءه بتاريخ 02/06/1435هـ وعدد العيادات التابعة له في مختلف مباني الجامعة أربع عيادات طبية بالإضافة الى المركز الطبي حالياً.

ونهدف الى زيادة عدد العيادات لتغطية جميع الفروع حيث ان المركز الطبي والعيادات التابعة له تقوم بخدمة 12 كلية يبلغ عدد موظفيها الإداريين (688) ويبلغ عدد اعضاء هيئة التدريس (819) كما يقدر عدد طلابها وطالباتها (23785) وبذلك يكون المجموع الكلي (25292).